该项目实施3年即取得17项创新成果和一批有重要价值的育种材料。其中7个高产、优质、抗病虫农作物新品种和6个微生物新菌株，累计创造17亿多元的经济效益。利用离子束重组DNA，育成的Vc高产新菌株，在国际上处于领先水平。
利用离子束辅助农杆菌遗传转化法，育成了一批抗病(虫)转基因水稻新品系；利用离子束介导法将玉米DNA转入水稻，育成了一批光合效率比原品种高80％的高光效水稻；将大豆DNA转入小麦，育成了蛋白含量高达25．3％的高蛋白小麦。研究人员发明的离子束介导远缘分子杂交技术，将西瓜与银杏分子杂交，获得产银杏内脂的西瓜。这些特殊材料培育成功，对解决育种遗传基础狭窄难题将起到重要作用。该项研究在基础理论方面也获得了重大进展，有关论文在国际上产生了重大影响。
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